Le pain complet est fabriqué avec une farine moins raffinée, qui conserve le son et le germe du blé. Cette farine, plus riche en fibres et en nutriments, coûte généralement plus cher à produire et à conserver, car elle se garde moins longtemps et demande plus de précautions.

De plus, la recette du pain complet demande souvent un temps de fermentation plus long et un savoir-faire particulier pour obtenir une mie aérée et savoureuse. Tout cela se répercute sur le prix final en boulangerie.