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Parce que les Portugais ont été les premiers Européens à commercer avec le Japon au XVIe siècle.
Au XVIe siècle, les Portugais sont arrivés au Japon, bien avant les autres Européens. Ils ont introduit de nouvelles marchandises (armes à feu, tabac, sucreries) et aussi des mots pour désigner ces nouveautés.
C’est ainsi que le mot pan (pain), botan (bouton), ou encore tempura (plat frit) sont entrés dans le japonais, adaptés à la prononciation locale.
Ces mots portugais sont restés car ils correspondaient à des objets ou des idées inconnus des Japonais avant l’arrivée des Européens.
Le mot japonais arigatô (merci) ressemble au portugais obrigado, mais c’est un pur hasard : ils n’ont aucun lien étymologique !