Le mont Fuji doit sa silhouette conique presque parfaite à sa structure géologique : il s’est construit au fil des millénaires par l’accumulation de coulées de lave fluides et de dépôts de cendres volcaniques qui se sont superposés de façon régulière autour du cratère central.

Ce type de volcan, appelé stratovolcan, a tendance à créer des pentes harmonieuses et symétriques, contrairement aux volcans explosifs ou aux volcans-boucliers, plus irréguliers. Les éruptions du Fuji ont été assez répétitives et centrées, ce qui a renforcé cette forme parfaitement conique que l’on admire aujourd’hui.